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  • LK-6916 染色质免疫沉淀(ChIP)试剂盒
  • LK-6916 染色质免疫沉淀(ChIP)试剂盒

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产品描述

染色质免疫沉淀(ChIP)试剂盒LK-6916

产品概述  

本染色质免疫沉淀(ChIP)试剂盒提供完整的实验流程和试剂,用于研究转录因子与DNA结合位点的相互作用。适用于高通量测序(ChIP-Seq)或定量PCRChIP-qPCR)分析。  

产品规格  

- 试剂盒包含40ChIP实验所需试剂。  

- 储存条件:部分试剂需-20℃保存,部分试剂需4℃保存。  

1. 简介  

染色质免疫沉淀(ChIP)是一种用于研究蛋白质与DNA相互作用的技术。通过交联、裂解、免疫沉淀和DNA纯化等步骤,可鉴定特定转录因子或组蛋白修饰在基因组中的结合位点。  

2. 技术路线  

1. 交联:用甲醛固定细胞,使蛋白质与DNA交联。  

2. 细胞核制备:裂解细胞,提取细胞核。  

3. 超声裂解:将染色质片段化为200-1000 bp的片段。  

4. 免疫沉淀:使用特异性抗体富集目标蛋白-DNA复合物。  

5. 洗涤与洗脱:去除非特异性结合,洗脱目标DNA。  

6. 解交联与纯化:逆转交联,纯化DNA用于后续分析。  

3. 试剂列表  

编号

试剂名称

体积(40次)

储存条件

1

甘氨酸溶液

40 mL

4℃

2

裂解缓冲液1

40 mL

4℃

3

裂解缓冲液2

20 mL

4℃

4

裂解缓冲液3

36.8 mL

4℃

5

琼脂糖磁珠

3 mL

4℃

6

Protein A/G磁珠

800 μL

4℃

7

洗脱缓冲液

28 mL

4℃

8

洗涤缓冲液

80 mL

4℃

9

TE洗涤缓冲液

80 mL

4℃

10

1×TE缓冲液

16 mL

4℃

11

EDTA溶液

320 μL

4℃

12

5M NaCl溶液

2 mL

4℃

13

糖原

80 μL

4℃

14

无菌水

4 mL

4℃

21

蛋白酶抑制剂

960 μL

-20℃

22

DTT溶液

960 μL

-20℃

23

封闭液

40 mL

-20℃

24

IgG抗体

100 μL

-20℃

25

RNase A

640 μL

-20℃

26

Proteinase K

320 μL

-20℃

注意:

- 4℃保存的试剂若出现粘稠或絮状物,使用前需恢复至室温或37℃预热至澄清。  

- 保质期为12个月,详见外包装标签。  

4. 操作步骤  

4.1 交联  

1. 1%甲醛固定细胞,室温交联10分钟。  

2. 加入甘氨酸终止交联,冰上孵育5分钟。  

3. 离心收集细胞,用PBS洗涤两次。  

4.2 细胞核制备  

1. 用裂解缓冲液12裂解细胞,离心收集细胞核。  

2. 用裂解缓冲液3重悬沉淀,冰上裂解10分钟。  

4.3 超声裂解  

1. 超声破碎染色质至200-750 bpChIP-Seq)或300-1000 bpChIP-qPCR)。  

2. 离心取上清,电泳检测片段大小。  

4.4 免疫沉淀  

1. 将样品分为IP组、IgG组和Input组。  

2. IP组加入特异性抗体,IgG组加入对照抗体,4℃孵育过夜。  

3. 加入Protein A/G磁珠,室温结合30分钟。  

4.5 洗涤与洗脱  

1. 用洗涤缓冲液和TE洗涤缓冲液洗涤磁珠。  

2. 用洗脱缓冲液65℃洗脱DNA。  

4.6 解交联与纯化  

1. 65℃解交联6小时或过夜。  

2. RNase AProteinase K处理样品。  

3. 乙醇沉淀DNA,溶解于无菌水中。  

5. 对照设置  

组别

描述

检测基因

Input组

样本对照组

阳性对照、GAPDH、研究基因

IP组

实验组

阳性对照、GAPDH、研究基因

IgG组

阴性对照组

阳性对照、GAPDH、研究基因