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  • LK-80801 RIP-Assay Kit
  • LK-80801 RIP-Assay Kit

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产品描述

RIP-Assay KitLK-80801

产品介绍  

RIP Assay KitRNA Immunoprecipitation Kit)是用于研究细胞内RNA与蛋白质相互作用的强大工具。该技术基于使用特异性抗体靶向目的蛋白,进而共沉淀与该蛋白结合的RNA分子。

本试剂盒提供了进行RNA免疫沉淀实验所需的全套优化试剂,包括经过特殊处理的磁珠、高效的免疫沉淀缓冲液、蛋白酶K以及用于下游RNA纯化和分析的必备组分。通过本试剂盒,您可以高效、特异地富集与RNA结合蛋白(RBP)结合的RNA,并结合qRT-PCR或高通量测序(RIP-Seq)等技术进行后续分析,广泛应用于揭示转录后调控机制、非编码RNA功能、病毒感染机制等研究领域。

产品特点  

1.  高特异性与灵敏度: 优化的缓冲体系能有效降低非特异性结合背景,确保RNA-蛋白复合物的高效和特异性富集。

2.  兼容性强: 富集后的RNA纯度高,完整性好,可直接用于下游应用,如qRT-PCR、微阵列分析或高通量测序(RIP-Seq)。

3.  操作便捷: 采用磁珠法进行免疫沉淀,操作简单快捷,避免了繁琐的离心步骤,易于处理多个样本。

4.  稳定性好: 试剂盒核心组分经过严格质检,批间差小,实验结果稳定可靠。

5.  齐全完备: 一盒包含除抗体和裂解液外的所有必需试剂,节省您的准备时间。  

使用方法(仅供参考)  

实验前准备:

   自备试剂:细胞裂解液(强烈推荐使用试剂盒配套的Cell Lysis Buffer或含有RNase抑制剂及蛋白酶抑制剂的RIPA缓冲液)、特异性抗体、IgG同型对照抗体、无RNase水、75%乙醇、异丙醇等。

   仪器设备:磁力架、离心机、涡旋振荡器、水浴锅/金属浴、无RNase的枪头和离心管。

实验流程:

A. 细胞裂解物制备

1.  培养并收集所需数量的细胞(通常~1x10cells/IP)。

2.  用预冷的PBS清洗细胞两次。

3.  加入适量预冷的细胞裂解液(含蛋白酶抑制剂和RNase抑制剂)重悬细胞,冰上孵育15分钟。

4.  4, 14,000 rpm离心15分钟,取上清即为细胞总裂解物。立即进行下一步或-80℃保存。

B. 抗体-磁珠复合物制备

1.  取适量Protein A/G磁珠悬液于无RNase离心管中,用磁力架吸附,弃上清。

2.  IP Wash Buffer清洗磁珠3次,重悬于适量IP Wash Buffer中。

3.  向清洗后的磁珠中加入推荐用量(通常0.5-5 µg)的特异性抗体或IgG对照抗体。

4.  室温旋转孵育30-60分钟,使抗体与磁珠充分结合。

5.  用磁力架吸附,弃上清。用IP Wash Buffer清洗磁珠2次,去除未结合的抗体。

C. RNA-蛋白复合物的免疫沉淀

1.  取一定体积的细胞裂解物(总蛋白量约500-2000 µg)至新的无RNase管中,用IP Buffer稀释至500 µL

2.  将稀释后的裂解物加入至制备好的抗体-磁珠复合物中。

3.  4℃旋转孵育2-4小时或过夜。

4.  孵育结束后,用磁力架吸附磁珠,小心弃去上清。

D. 洗涤与RNA洗脱

1.  用预冷的High Salt Wash Buffer清洗磁珠4次,每次5分钟,确保彻底去除非特异性结合的核酸。

2.  Low Salt Wash Buffer快速清洗磁珠1次。

3.  向沉淀的磁珠中加入Proteinase K Buffer(含蛋白酶K),55℃水浴震荡孵育30分钟,降解蛋白并释放结合的RNA

E. RNA的纯化与检测

1.  向反应液中加入等体积的RNA Binding Buffer,混匀。

2.  将混合液转移至纯化柱中,离心,弃滤液。

3.  Wash Buffer清洗纯化柱两次。

4.  离心干燥后,用Elution Buffer或无RNase水洗脱RNA

5.  立即使用获得的RNA进行qRT-PCR分析,或于-80℃保存备用。

注意事项  

1.  RNase污染控制: 整个实验过程必须严格遵循无RNase操作规范,佩戴手套,使用无RNase的枪头、离心管和试剂。

2.  抗体选择: 抗体的特异性和有效性是实验成功的关键。请确保使用经IPChIP验证过的抗体,并设置同型IgG对照以排除非特异性结合。

3.  样品新鲜度: 尽量使用新鲜制备的细胞裂解物,以避免RNA降解和复合物解离。

4.  缓冲液配制: 所有缓冲液请按说明书指示配制,并确保试剂完全溶解,pH值准确。

5.  实验优化: 对于新研究的蛋白,需对抗体用量、裂解物投入量及孵育时间等进行优化。

6.  安全操作: 本试剂盒含有刺激性化学品,请佩戴适当的个人防护装备。废弃液请按实验室规定处理。  

常见问题解答  

Q1: 实验没有检测到信号或信号很弱,可能的原因是什么?

   A: 可能原因包括:① 抗体效率不高或不能用于IP;② 细胞裂解物中目标蛋白或RNA表达量过低;③ RNA在操作过程中降解;④ 洗涤过于剧烈,导致复合物脱落。建议设置Input对照验证RNA完整性,优化抗体和裂解物用量。

Q2: 实验背景很高(对照组也有信号),如何解决?

   A: 可能原因:① 抗体非特异性结合强;② 洗涤不充分。可尝试增加洗涤次数或使用更高盐浓度的洗涤液,确保使用有效的同型对照,并尝试不同的抗体。

Q3: Input组和IP组的RNA完整性都很好,但IP产量低怎么办?

   A: 可能原因:① 抗体与磁珠结合效率低;② 免疫沉淀孵育时间不足;③ 裂解缓冲液条件不适合目标蛋白-RNA复合物的稳定存在。可延长抗体与磁珠及IP的孵育时间,或检查裂解液配方。

Q4: 洗脱的RNA能否直接用于qRT-PCR

   A: 可以。本试剂盒纯化后的RNA纯度足以直接用于反转录和qRT-PCR。若用于测序,建议进一步检测RNA的完整性和纯度(如RIN值)。

Q5: 试剂盒中的磁珠是什么类型的?

   A: 本试剂盒提供的是Protein A/G混合磁珠,具有更广泛的物种和抗体亚型兼容性,可结合大多数IgG。  

产品声明
本产品仅限于科研,如需储存珍贵样本,请自行小规模尝试后大批量实验,产品售后仅限产品本身,无其他任何连带责任,请须知

本产品仅供研究使用,不适用于临床诊断或治疗。