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PNGase F,LK-8705
产品介绍
PNGase F 是一种酰胺水解酶,能够催化切割天冬酰胺(Asn)连接的寡糖与多肽或蛋白质主链之间的β-天冬氨酰葡萄糖胺键。它能高效、彻底地切除绝大多数真核生物蛋白质上的N-连接聚糖,无论其结构复杂性如何(高甘露糖型、杂合型或复杂型)。
该酶是糖生物学研究、蛋白质组学、生物制药质量控制和糖蛋白表征中的核心工具酶。通过去除糖链,可以研究糖基化对蛋白质结构、功能、稳定性、免疫原性和药代动力学的影响。
产品特点
1. 高切割效率: 能在较短时间内(通常1-3小时)完全去除N-连接糖链。
2. 广泛的底物特异性: 可切割所有类型的N-连接聚糖(高甘露糖型、杂合型、复杂型),适用性极广。
3. 高纯度: 经过严格纯化,不含其他蛋白酶和糖苷酶污染,确保反应的特异性和蛋白质底物的完整性。
4. 活性稳定: 在推荐的缓冲液体系中活性稳定,批间差小,实验结果重复性好。
5. 灵活的反应条件: 提供变性或非变性反应方案,以适应不同性质的蛋白质样品。
使用方法(仅供参考)
注意: 以下为通用操作流程,具体实验条件可能需要根据您的样品进行优化。强烈建议在进行关键实验前进行预实验。
A. 变性条件下的酶切反应(推荐用于难溶性或结构紧密的糖蛋白)
1. 样品变性:
取适量糖蛋白样品(建议1-50 µg)于离心管中。
加入1xGlycoprotein Denaturing Buffer(通常含0.5% SDS,40 mM DTT),混匀。
在100°C 加热3-10分钟,使蛋白质完全变性。
短暂离心,收集管壁液体。
2. 配制反应体系:
将变性后的样品冷却至室温。
依次加入以下组分(以50 µL总体系为例):
组分 | 体积 | 终浓度 |
变性后的糖蛋白样品 | X µL | 1-50 µg |
10× Reaction Buffer (如: G7) | 5 µL | 1× |
10% NP-40 或 Triton X-100 | 5 µL | 1% |
PNGase F 酶 (≥500,000 U/mL) | 1-2 µL | 10-20 U |
无核酸酶水 | 补足至 50 µL | - |
注意: 加入去垢剂(如NP-40)至关重要,用于中和SDS对PNGase F的抑制作用。确保NP-40的浓度至少是SDS浓度的2倍(例如,0.5% SDS需加1% NP-40)。
3. 酶切反应:
轻轻吹打混匀,短暂离心。
在37°C 水浴或孵育器中反应1-3小时。对于糖基化程度高或难切的样品,可延长至过夜(16-18小时)。
4. 终止反应与分析:
反应完成后,可将样品置于-20°C 保存,或直接进行后续分析。
通过SDS-PAGE(观察分子量迁移)、Western Blot(使用凝集素或特异性抗体)、质谱(MS)或HPLC等方法验证去糖基化效果。
B. 非变性条件下的酶切反应(适用于可溶性好、结构松散的糖蛋白)
1. 配制反应体系:
在离心管中直接配制以下体系:
组分 | 体积 | 终浓度 |
糖蛋白样品(溶于非变性缓冲液) | X µL | 1-50 µg |
10× Reaction Buffer (如: G7) | 5 µL | 1× |
PNGase F 酶 (≥500,000 U/mL) | 1-2 µL | 10-20 U |
无核酸酶水 | 补足至 50 µL | - |
2. 酶切反应与终止:
混匀后,在37°C 反应1-3小时或过夜。
反应完成后,进行后续分析。
注意事项
1. 储存与使用: 本品应在-20°C 冷冻保存。使用时请置于冰上,用后立即放回-20°C,避免反复冻融。
2. 去垢剂控制: 在变性反应方案中,必须加入足量的非离子去垢剂(如NP-40)来中和SDS,否则酶活性将被完全抑制。
3. 样品兼容性: 避免在反应体系中引入高浓度的盐酸胨、尿素、硫酸铵、甘油或强螯合剂(如EDTA),这些物质可能抑制酶活。确保反应缓冲液中含有适量的EDTA(如1-10 mM)以稳定酶活性。
4. 对照设置: 每次实验都应设置阴性对照(不加PNGase F,但经过相同的处理流程),以确认分子量的变化确实由酶切引起。
5. 酶活性单位: 1单位(U)PNGase F 定义为在37°C、pH 7.5条件下,1分钟内从1 nmol的RNase B中释放1 nmol寡糖所需的酶量。
6. 个人防护: 实验时请穿着实验服、戴手套,遵守实验室安全规程。
常见问题解答
Q1:PNGase F 酶切后,为什么在SDS-PAGE上看不到分子量变化?
A: 可能原因有:
蛋白质本身糖基化程度很低或没有N-连接糖链。
酶活性不足或失活(检查储存条件和操作过程)。
反应条件不当(如SDS未被充分中和,pH值不适宜)。
糖链太小,导致的分子量变化在凝胶上无法分辨。建议使用Western Blot(凝集素染色)或质谱进行更灵敏的检测。
Q2:PNGase F 可以切割O-连接糖链吗?
A: 不可以。PNGase F 特异性作用于N-连接糖链。去除O-连接糖链需要使用不同的酶,如O-糖苷酶(O-Glycosidase),通常需要与神经氨酸酶(Sialidase)和β1-4半乳糖苷酶(β1-4 Galactosidase)联用。
Q3:我的蛋白质含有二硫键,在变性条件下会被还原吗?
A: 是的,标准的变性缓冲液中含有还原剂(如DTT或β-巯基乙醇),会破坏二硫键。如果您需要保持二硫键的完整性,请寻找不含还原剂的特殊变性方案或尝试在非变性条件下进行酶切。
Q4:反应缓冲液的最佳pH是多少?
A: PNGase F 的最适pH范围为7.5 - 8.5。本产品提供的10× Reaction Buffer通常将pH优化在此范围内。
Q5:如何确定酶切是否完全?
A: 最可靠的方法是质谱分析。通过比较酶切前后的分子量,可以精确判断糖链是否被完全去除。SDS-PAGE上的条带变为单一、清晰的低分子量条带也是一个很好的指示。
Q6:PNGase F 能否切除所有N-糖链?是否存在例外?
A: 绝大多数N-糖链都可被PNGase F切割。一个罕见的例外是某些植物糖蛋白上存在的含有α1,3-核心岩藻糖的N-糖链,对PNGase F有抗性。在这种情况下,可能需要使用PNGase A。
产品声明
本产品仅限于科研,如需储存珍贵样本,请自行小规模尝试后大批量实验,产品售后仅限产品本身,无其他任何连带责任,请须知。
本产品仅供研究使用,不适用于临床诊断或治疗。